141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1371 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  100 
 
 
474 aa  964    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  38.15 
 
 
918 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  35.2 
 
 
452 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
841 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.33 
 
 
476 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.53 
 
 
841 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  24.64 
 
 
452 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.42 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.75 
 
 
462 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  24.89 
 
 
860 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  29.35 
 
 
516 aa  80.1  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  21.32 
 
 
857 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  29.26 
 
 
785 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 
837 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  26.51 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  24.43 
 
 
662 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  25.56 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  22.78 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  27.08 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.67 
 
 
695 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  29.7 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  22.19 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  24.68 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  21.04 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  23.58 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  23.14 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  22.71 
 
 
474 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  23.72 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  23.58 
 
 
457 aa  63.9  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  24.24 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  24.11 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  24.24 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  24.24 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  24.24 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.81 
 
 
470 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.42 
 
 
290 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  21.57 
 
 
477 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  27.37 
 
 
276 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  23.97 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  21.03 
 
 
465 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.38 
 
 
240 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.36 
 
 
314 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  21.82 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  31.63 
 
 
277 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  22.55 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  22.73 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  24.19 
 
 
619 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  22.73 
 
 
465 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  22.73 
 
 
465 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  20.66 
 
 
469 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  23.78 
 
 
465 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  23.78 
 
 
465 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
229 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.93 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.147143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0751  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.09 
 
 
328 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0839232  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0556  iron-sulfur cluster-binding protein  26.4 
 
 
346 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.850288  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.62 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 
216 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  26.56 
 
 
763 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  26.56 
 
 
787 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.84 
 
 
181 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  24 
 
 
802 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.75 
 
 
331 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.98 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2604  iron-sulfur cluster-binding protein  26.47 
 
 
339 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  27.27 
 
 
292 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.83 
 
 
354 aa  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.2 
 
 
357 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  22.27 
 
 
367 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.2 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  26.06 
 
 
205 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  26.47 
 
 
713 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.08 
 
 
238 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.2 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.2 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 
241 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000727227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.63 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0729  iron-sulfur cluster-binding protein  24.22 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  25.11 
 
 
710 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  25.88 
 
 
743 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.9 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01643  predicted 4Fe-4S ferridoxin-type protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0323242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1968  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2387  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00833756  hitchhiker  0.0000441402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
368 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1755  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.71 
 
 
294 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1957  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00915  hitchhiker  0.000000199442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1523  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00369582  hitchhiker  0.0000000711614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  25.11 
 
 
710 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  26.25 
 
 
788 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  26.27 
 
 
749 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1889  hypothetical protein  36.25 
 
 
208 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.32 
 
 
316 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>