34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2925 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  61.15 
 
 		 815 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0304  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.37 
 
 		 954 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4914  cyclic nucleotide-binding protein  52.53 
 
 		 943 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 802 aa  1674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  61.02 
 
 		 815 aa  1059    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0131  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.38 
 
 		 941 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222865  normal  0.40749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  48.76 
 
 		 716 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0304  cyclic nucleotide-binding protein  52.37 
 
 		 954 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  29.86 
 
 		 149 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  29.17 
 
 		 149 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  29.5 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  27.63 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 149 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  28.97 
 
 		 154 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2129  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.66 
 
 		 996 aa  73.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052941 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  28.89 
 
 		 163 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  25.17 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  25.58 
 
 		 132 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1103  predicted protein  30.07 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0462074  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  27.97 
 
 		 522 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  39.06 
 
 		 75 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  24.09 
 
 		 143 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  28.15 
 
 		 175 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  27.56 
 
 		 181 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  26.06 
 
 		 479 aa  51.2  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  24 
 
 		 474 aa  50.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10513  predicted protein  28.68 
 
 		 131 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2828  putative ferredoxin-type membrane protein  20.63 
 
 		 367 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03510  myosin, light chain 2, 20 kDa, putative  21.08 
 
 		 199 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  27.03 
 
 		 174 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35352  predicted protein  33.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0604437 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12820  calcium dependent protein kinase  25.93 
 
 		 402 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.757606  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  24.31 
 
 		 466 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02120  calcium ion binding protein, putative  25 
 
 		 172 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>