69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1451 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 516 aa  1042    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  31.41 
 
 		 619 aa  238  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.93 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.15 
 
 		 476 aa  160  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.21 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  25.24 
 
 		 841 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 		 785 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  30.45 
 
 		 837 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.23 
 
 		 841 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  30.6 
 
 		 838 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.93 
 
 		 695 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  28.02 
 
 		 662 aa  94.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 		 860 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  25.5 
 
 		 452 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  32.39 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.99 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  29.35 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  23.29 
 
 		 918 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  23.7 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  22.75 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  31.79 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  31.79 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  30.26 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  23.74 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  23.97 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  23.74 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  23.74 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  23.74 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  23.74 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  23.74 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  24.05 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  28.06 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  28.48 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  29.29 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  23.66 
 
 		 466 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  24.36 
 
 		 465 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  24.36 
 
 		 465 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  24.36 
 
 		 465 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  23.21 
 
 		 465 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  23.87 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  24.79 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  23.65 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  23.65 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  25.68 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  25.77 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.6 
 
 		 247 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  23.99 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  26.88 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.17 
 
 		 591 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22.8 
 
 		 299 aa  47.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  24.62 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.89 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  33.68 
 
 		 277 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.1 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.02 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  23.67 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 		 273 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.09 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.81 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.27 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 232 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0556  iron-sulfur cluster-binding protein  30.99 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.850288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1466  iron-sulfur cluster-binding protein  24.29 
 
 		 344 aa  43.9  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2604  iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 		 339 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.89 
 
 		 358 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>