92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0511 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  81.44 
 
 		 464 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  98.93 
 
 		 466 aa  921    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  98.93 
 
 		 466 aa  921    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  98.71 
 
 		 466 aa  919    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  83.69 
 
 		 465 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  98.93 
 
 		 466 aa  921    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  83.84 
 
 		 465 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  83.69 
 
 		 465 aa  787    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  81.66 
 
 		 468 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  94.64 
 
 		 466 aa  884    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  83.19 
 
 		 469 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  85.84 
 
 		 465 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  84.55 
 
 		 465 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  99.36 
 
 		 466 aa  923    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  84.05 
 
 		 465 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  83.48 
 
 		 465 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  98.93 
 
 		 466 aa  921    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  62.58 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  57.33 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  54.75 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  54.37 
 
 		 477 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  55.19 
 
 		 477 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  56.02 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  52.39 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  49.34 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  38.06 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  44.95 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  44.95 
 
 		 440 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  24.28 
 
 		 918 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.88 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.37 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.16 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  29.02 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 841 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 		 841 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 		 837 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  26.12 
 
 		 785 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  27.85 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 860 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  29.52 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  24.74 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.16 
 
 		 695 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  23.7 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  23.74 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  31.25 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  23.81 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  23.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  23.14 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  23.81 
 
 		 357 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.38 
 
 		 357 aa  57  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 357 aa  57  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  28.11 
 
 		 292 aa  57  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 		 857 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.38 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  26.74 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.48 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.37 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  24.9 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  29.38 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  23.91 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.43 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.42 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 247 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 703 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.76 
 
 		 325 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.2 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.46 
 
 		 728 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  26.4 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.23 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.8 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  23.12 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  23.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.91 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 726 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.86 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.44 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.76 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.14 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  24.73 
 
 		 716 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  27.14 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.47 
 
 		 272 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  27.94 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22.4 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  26.82 
 
 		 303 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 714 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  25.53 
 
 		 279 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  26.67 
 
 		 302 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>