27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2045 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  50.93 
 
 
815 aa  734    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0304  cyclic nucleotide-binding protein  50.88 
 
 
954 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  51.22 
 
 
815 aa  734    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  48.76 
 
 
802 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  100 
 
 
716 aa  1489    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4914  cyclic nucleotide-binding protein  52.72 
 
 
943 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0304  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.88 
 
 
954 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0131  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.84 
 
 
941 aa  624  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222865  normal  0.40749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2129  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.89 
 
 
996 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052941 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  43.94 
 
 
154 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  43.33 
 
 
163 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2828  putative ferredoxin-type membrane protein  21.92 
 
 
367 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  36.36 
 
 
149 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 
149 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  31.88 
 
 
149 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  30.3 
 
 
149 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  31.75 
 
 
75 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  25.39 
 
 
918 aa  45.8  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  34.48 
 
 
192 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  24.67 
 
 
474 aa  44.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  24.73 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>