More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29251 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
695 aa  1390    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  62.77 
 
 
662 aa  809    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
841 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.01 
 
 
841 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  42.19 
 
 
838 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  45.54 
 
 
837 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  26.75 
 
 
857 aa  160  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.25 
 
 
476 aa  154  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.22 
 
 
860 aa  151  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
785 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.34 
 
 
476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.34 
 
 
462 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 
516 aa  98.6  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  23.16 
 
 
918 aa  84  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.17 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  27.35 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  24.29 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4134  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.19 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  27 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  28.03 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  28.03 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  28.03 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  28.03 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  28.03 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  25.67 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2941  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.24 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3125  putative sigma54 specific transcriptional regulator  26.92 
 
 
703 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.189473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1282  putative GAF sensor protein  27.43 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.49 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  28.45 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.24 
 
 
456 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2823  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.24 
 
 
456 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  28.88 
 
 
456 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  27.72 
 
 
619 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  33.16 
 
 
466 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  25.64 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  24.91 
 
 
452 aa  65.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0660  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.38 
 
 
460 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1503  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.29 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  25.94 
 
 
465 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  27.62 
 
 
466 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  27.62 
 
 
469 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.79 
 
 
491 aa  64.3  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2522  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  27.73 
 
 
509 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1832  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.57 
 
 
451 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0361  Fis family transcriptional regulator  26.39 
 
 
681 aa  64.3  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  31.31 
 
 
492 aa  64.3  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  29.79 
 
 
491 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  26.69 
 
 
465 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  26.6 
 
 
465 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  33.55 
 
 
471 aa  64.3  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.22 
 
 
441 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02717  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  31.9 
 
 
561 aa  63.9  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2667  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.92 
 
 
551 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  25.52 
 
 
465 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  25.52 
 
 
465 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  27.37 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0660  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.08 
 
 
461 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2578  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.2 
 
 
446 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1894  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.54 
 
 
456 aa  63.9  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.410758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  27.31 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  26.6 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3068  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 
452 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0671  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.24 
 
 
457 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  25.27 
 
 
511 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1313  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.46 
 
 
470 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1405  two component Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 
477 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0781313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  29.25 
 
 
474 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0070  putative sigma54 specific transcriptional regulator  30.51 
 
 
434 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.000000158676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1521  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0597009  normal  0.119428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1038  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 
468 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0701  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.95 
 
 
452 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.390786  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  27.12 
 
 
464 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.34 
 
 
512 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3227  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.11 
 
 
468 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1020  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  25.43 
 
 
516 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1959  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.44 
 
 
493 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1616  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.31 
 
 
452 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0727  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  32.14 
 
 
506 aa  61.2  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29 
 
 
459 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  26.77 
 
 
438 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2373  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.14 
 
 
544 aa  61.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1280  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.6 
 
 
446 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1300  putative phytochrome sensor protein  27.14 
 
 
518 aa  60.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0067  putative sigma54 specific transcriptional regulator  30.51 
 
 
430 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485042  hitchhiker  0.00677229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  24.9 
 
 
477 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.6 
 
 
446 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3230  flagellar regulatory protein C  30.17 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.88 
 
 
450 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.594792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1952  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  28 
 
 
545 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 
522 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1401  NifA subfamily transcriptional regulator  27.98 
 
 
562 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.68 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2880  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765557  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0124  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.04 
 
 
459 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.99079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0848  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.43 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23473  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6543  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.75 
 
 
456 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0700  hydrogenase sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.43 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2456  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  27.98 
 
 
525 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  27.92 
 
 
439 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>