87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3291 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
470 aa  951    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.58 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.33 
 
 
476 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  25.3 
 
 
841 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.61 
 
 
841 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.51 
 
 
462 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  25.65 
 
 
838 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  27.47 
 
 
837 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
785 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  22.99 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.17 
 
 
695 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  25.42 
 
 
619 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  27.43 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  26.69 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  28.57 
 
 
463 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  26.29 
 
 
918 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  28.17 
 
 
860 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  28.81 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.51 
 
 
857 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  24.09 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.11 
 
 
727 aa  57  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.23 
 
 
480 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 
489 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.63 
 
 
651 aa  53.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  29.76 
 
 
625 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
627 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 
334 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
641 aa  50.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  34.38 
 
 
872 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  34.88 
 
 
873 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  34.88 
 
 
873 aa  50.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.22 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  29.08 
 
 
886 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.48 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  34.02 
 
 
710 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.7 
 
 
294 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  33.33 
 
 
713 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  34.02 
 
 
887 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  34.02 
 
 
710 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  34.02 
 
 
887 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  34.02 
 
 
710 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  34.02 
 
 
710 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  33.33 
 
 
872 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.44 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2955  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00620817  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.3 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  38.16 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.02 
 
 
404 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.3 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.36 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
329 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.81 
 
 
229 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.7 
 
 
299 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
645 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.39 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  32.99 
 
 
897 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  30.3 
 
 
884 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  25.12 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  32.56 
 
 
719 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.75 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  31.87 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.53 
 
 
358 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.87 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  31.87 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.87 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 
290 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.87 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
713 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.87 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  31.87 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  31.87 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.87 
 
 
357 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.48 
 
 
356 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  28.19 
 
 
696 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  36.51 
 
 
570 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.33 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  31.96 
 
 
438 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  31 
 
 
758 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 
260 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 
335 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  23.9 
 
 
298 aa  43.5  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.11 
 
 
351 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1359  polyferredoxin-like  33.04 
 
 
381 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.49 
 
 
334 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  30.59 
 
 
708 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>