182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2637 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 758 aa  1548    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  42.69 
 
 		 743 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  43.85 
 
 		 699 aa  522  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  42.4 
 
 		 704 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  42.07 
 
 		 702 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  41.94 
 
 		 701 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  42.17 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  37.55 
 
 		 696 aa  436  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 714 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  42.88 
 
 		 727 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  33.88 
 
 		 714 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  35.01 
 
 		 703 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  35.41 
 
 		 715 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  34.84 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  33.73 
 
 		 715 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  35.67 
 
 		 715 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  34.53 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  32.09 
 
 		 716 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 708 aa  363  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  33.09 
 
 		 719 aa  360  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 713 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 726 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  30.27 
 
 		 749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  30.13 
 
 		 764 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  30.19 
 
 		 752 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  30.41 
 
 		 764 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  29.39 
 
 		 764 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.14 
 
 		 687 aa  300  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 788 aa  300  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  29.18 
 
 		 787 aa  299  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 681 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  31.17 
 
 		 728 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  30.48 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  29.29 
 
 		 884 aa  266  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  28.9 
 
 		 713 aa  263  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  28.72 
 
 		 710 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  28.72 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  28.72 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  28.72 
 
 		 710 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  39.58 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  28.31 
 
 		 727 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  27.79 
 
 		 886 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  27.4 
 
 		 872 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  26.68 
 
 		 873 aa  234  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  26.68 
 
 		 873 aa  234  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  26.72 
 
 		 897 aa  230  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  27.08 
 
 		 872 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  26.89 
 
 		 887 aa  221  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  26.89 
 
 		 887 aa  221  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.81 
 
 		 480 aa  92.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.04 
 
 		 368 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.46 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.38 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  28.31 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  26.98 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.37 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  27.98 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  30.32 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  29.34 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 645 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0118  iron-sulfur cluster-binding protein  28.44 
 
 		 319 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.67 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.79 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29.23 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  30.17 
 
 		 272 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  28.46 
 
 		 396 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.33 
 
 		 347 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  26.96 
 
 		 334 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.24 
 
 		 298 aa  56.6  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  29.72 
 
 		 316 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 		 282 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  28.02 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  32.39 
 
 		 437 aa  55.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  28.14 
 
 		 316 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  26.61 
 
 		 393 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  28.12 
 
 		 383 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 288 aa  54.3  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 229 aa  54.3  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.52 
 
 		 243 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.44 
 
 		 588 aa  53.5  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  28.74 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.22 
 
 		 358 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.22 
 
 		 356 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  23.56 
 
 		 275 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  26.97 
 
 		 346 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  26.56 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  29.21 
 
 		 396 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  26.94 
 
 		 290 aa  52  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>