96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2342 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 453 aa  920    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  46.42 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  32.4 
 
 		 391 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  34.49 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  30.51 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  33.15 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  31.93 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  33.13 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  31.12 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  29.46 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  27.7 
 
 		 397 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  28.9 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  28.61 
 
 		 383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  33.13 
 
 		 969 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  27.44 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  28.09 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  26.56 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  28.62 
 
 		 360 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  30.74 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  28.53 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  25.17 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 708 aa  77  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.18 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  28.21 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.51 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  28.26 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  27.41 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  28.12 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  26.26 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  26.7 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  25.06 
 
 		 638 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 714 aa  66.6  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 703 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.48 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  24.87 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  27.16 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  26.7 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  28.37 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  29.84 
 
 		 764 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  24.88 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  26.34 
 
 		 716 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.95 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 749 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.84 
 
 		 696 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 705 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  29.5 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  29.5 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  27.95 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  29.5 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  29.5 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  26.64 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  27.95 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  29.85 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  29.1 
 
 		 887 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  29.1 
 
 		 887 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  27.43 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  25.51 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  32.26 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  30.39 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  29.55 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  28.36 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  26.52 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 886 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  35.59 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  26.86 
 
 		 884 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  29.55 
 
 		 727 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  28.46 
 
 		 897 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  29.03 
 
 		 752 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.9 
 
 		 190 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  37 
 
 		 192 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.58 
 
 		 193 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.56 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  28.36 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  25.93 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 727 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 290 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  32.95 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0472  iron-sulfur cluster-binding protein  26.83 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  26.04 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  28.18 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.45 
 
 		 178 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.44 
 
 		 216 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.29 
 
 		 220 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.93 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.41 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>