173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4731 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  100 
 
 		 719 aa  1489    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  69.8 
 
 		 716 aa  1041    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  47.98 
 
 		 712 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  52.81 
 
 		 715 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  67.79 
 
 		 708 aa  1007    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  50.35 
 
 		 714 aa  748    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  49.71 
 
 		 714 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  69.83 
 
 		 713 aa  1028    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  52.66 
 
 		 715 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  42.65 
 
 		 764 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  42.48 
 
 		 764 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  43.12 
 
 		 726 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  41.56 
 
 		 787 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  41.98 
 
 		 752 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 788 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 749 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  40.32 
 
 		 764 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  40.89 
 
 		 728 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  39.16 
 
 		 763 aa  519  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  39.17 
 
 		 884 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 873 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  37.74 
 
 		 873 aa  445  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.26 
 
 		 727 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  36.12 
 
 		 743 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  37.32 
 
 		 886 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  34.74 
 
 		 687 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 703 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  36.8 
 
 		 710 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  37.01 
 
 		 872 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  37.48 
 
 		 872 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  36.8 
 
 		 710 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  36.8 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  36.95 
 
 		 710 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  36.65 
 
 		 710 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  35.81 
 
 		 897 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  36.13 
 
 		 887 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  36.13 
 
 		 887 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.17 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  37.98 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  37.62 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  34.37 
 
 		 681 aa  389  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  32.94 
 
 		 758 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  33.59 
 
 		 704 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  33.9 
 
 		 701 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 705 aa  360  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  50 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  30.88 
 
 		 696 aa  317  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 727 aa  316  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.93 
 
 		 480 aa  92.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  29.7 
 
 		 357 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.79 
 
 		 444 aa  77  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.82 
 
 		 368 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.85 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  25.91 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  28.64 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  26.04 
 
 		 360 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  29.7 
 
 		 277 aa  67.4  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  26.09 
 
 		 396 aa  66.6  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.74 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  30.05 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.69 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  31.82 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.58 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.5 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  28.3 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  26.98 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  26.42 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 		 351 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 356 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.93 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29.12 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  24.89 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 404 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.93 
 
 		 356 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.39 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.06 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.49 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.54 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.63 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  22.33 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0118  iron-sulfur cluster-binding protein  27.59 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>