118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1596 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 397 aa  804    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  93.95 
 
 		 397 aa  748    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  91.44 
 
 		 397 aa  734    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  44.62 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  40.97 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  44.54 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  41.71 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  42.35 
 
 		 572 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  43.39 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  30.94 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  31.22 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  30.9 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  26.56 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  28.32 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  26.46 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  26.34 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  28.39 
 
 		 969 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  31.78 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  25.44 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  24.3 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  32.16 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  32.09 
 
 		 764 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  32.16 
 
 		 715 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  24.45 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  30.86 
 
 		 752 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  28.71 
 
 		 704 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  29.84 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  32.09 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  32.09 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  30.27 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  32.16 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 713 aa  67  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  31.35 
 
 		 764 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 873 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  31.85 
 
 		 872 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  29.07 
 
 		 764 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  31.62 
 
 		 873 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  32.59 
 
 		 872 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 708 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  27.98 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  26.46 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 886 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  27.75 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.19 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  32.59 
 
 		 887 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  32.59 
 
 		 887 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  30.32 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  30.32 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  30.32 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  26.62 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  30.51 
 
 		 710 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  30.37 
 
 		 897 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  28.39 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  27.37 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  31.25 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.47 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  25.1 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  28.81 
 
 		 696 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  25.94 
 
 		 714 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35 
 
 		 580 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  29.84 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.27 
 
 		 625 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27.27 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  26.18 
 
 		 699 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  27.95 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  27.78 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  27.78 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.63 
 
 		 197 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  27.95 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  32.54 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  28.47 
 
 		 727 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.47 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  24.94 
 
 		 638 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  26.34 
 
 		 692 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  30.97 
 
 		 201 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.43 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.08 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  28.14 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  35.44 
 
 		 173 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  35.44 
 
 		 173 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 758 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.72 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  35.56 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  26.62 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  27.32 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.07 
 
 		 177 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>