187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0663 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  67.59 
 
 
887 aa  1006    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  68.56 
 
 
872 aa  989    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  58.84 
 
 
710 aa  846    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  62.47 
 
 
884 aa  921    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  58.84 
 
 
710 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  67.59 
 
 
887 aa  1006    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  70.48 
 
 
886 aa  1032    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  57.85 
 
 
713 aa  839    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  100 
 
 
727 aa  1487    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  68.21 
 
 
897 aa  1023    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  68.09 
 
 
872 aa  994    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  68.67 
 
 
873 aa  1032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  68.81 
 
 
873 aa  1033    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  58.7 
 
 
710 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  58.84 
 
 
710 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  37.92 
 
 
714 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  38.36 
 
 
715 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  38.51 
 
 
715 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  37.71 
 
 
714 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  37.26 
 
 
719 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  34.25 
 
 
716 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  38.17 
 
 
712 aa  426  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  35.59 
 
 
764 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  34.73 
 
 
764 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  34.03 
 
 
713 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  35.23 
 
 
764 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  36.02 
 
 
752 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
708 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  34.81 
 
 
749 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  35.05 
 
 
787 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  34.21 
 
 
726 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  32.67 
 
 
788 aa  361  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.38 
 
 
728 aa  352  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  33.19 
 
 
763 aa  336  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  31.98 
 
 
703 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.23 
 
 
687 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  31.13 
 
 
715 aa  321  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
681 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  30.87 
 
 
743 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  31.56 
 
 
704 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  32.07 
 
 
692 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  30.16 
 
 
701 aa  296  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  31.5 
 
 
705 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  32.08 
 
 
702 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  31.32 
 
 
699 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  28.46 
 
 
758 aa  251  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  28.85 
 
 
696 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  41.48 
 
 
625 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  31.24 
 
 
727 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.18 
 
 
480 aa  97.8  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.21 
 
 
240 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.73 
 
 
229 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.54 
 
 
288 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  30.37 
 
 
357 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  27.68 
 
 
233 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.84 
 
 
357 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.35 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.35 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  29.02 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  29.35 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.86 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.02 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.35 
 
 
331 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.89 
 
 
331 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  33.14 
 
 
437 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.02 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.46 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.34 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.05 
 
 
290 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.14 
 
 
335 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1052  iron-sulfur cluster-binding protein  29.02 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000925292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  31.7 
 
 
290 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  30.51 
 
 
431 aa  72  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.8 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.61 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.5 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.42 
 
 
356 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25 
 
 
181 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  29.87 
 
 
572 aa  65.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.77 
 
 
294 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.89 
 
 
358 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.18 
 
 
334 aa  64.3  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.96 
 
 
285 aa  64.3  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
347 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  30.64 
 
 
354 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.47 
 
 
507 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.13 
 
 
444 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.67 
 
 
257 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.79 
 
 
350 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.07 
 
 
260 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.05 
 
 
299 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0751  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.09 
 
 
328 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0839232  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.55 
 
 
404 aa  62  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>