205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4868 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  100 
 
 
701 aa  1378    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  76.92 
 
 
699 aa  1013    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  70.08 
 
 
727 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  93.06 
 
 
704 aa  1256    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  93.15 
 
 
705 aa  1232    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  48.14 
 
 
743 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  49.26 
 
 
702 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  42.51 
 
 
758 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  43.22 
 
 
696 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  35.81 
 
 
703 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  37.2 
 
 
715 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  37.18 
 
 
692 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  35.07 
 
 
714 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  38.04 
 
 
715 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  37.65 
 
 
715 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  32.48 
 
 
708 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  33.05 
 
 
719 aa  363  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  35.58 
 
 
749 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  34.43 
 
 
714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  35.14 
 
 
687 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  34.37 
 
 
712 aa  357  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
726 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.89 
 
 
764 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  33.23 
 
 
764 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  31.99 
 
 
716 aa  346  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  32.44 
 
 
764 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  33.43 
 
 
752 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  36.65 
 
 
728 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  31 
 
 
713 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  32.2 
 
 
788 aa  339  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  31.79 
 
 
787 aa  333  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  34.89 
 
 
713 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  34.98 
 
 
710 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  34.82 
 
 
710 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  34.82 
 
 
710 aa  317  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  34.82 
 
 
710 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  31.2 
 
 
763 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
681 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  31.75 
 
 
886 aa  300  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  30.3 
 
 
727 aa  290  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  30.99 
 
 
873 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  30.99 
 
 
873 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  32.83 
 
 
884 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  32.21 
 
 
897 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  31.58 
 
 
872 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  30.65 
 
 
887 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  30.65 
 
 
887 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  30.82 
 
 
872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  40.61 
 
 
625 aa  230  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.61 
 
 
480 aa  104  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.5 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.56 
 
 
591 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.91 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  32.98 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  32.98 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  32.98 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.47 
 
 
524 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  32.98 
 
 
357 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
357 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
357 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.45 
 
 
357 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.04 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.14 
 
 
325 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.76 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.43 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.85 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.76 
 
 
356 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  29.82 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  23.81 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.29 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.89 
 
 
229 aa  67  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.94 
 
 
507 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
645 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.93 
 
 
243 aa  66.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.71 
 
 
347 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  27.16 
 
 
453 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.24 
 
 
356 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  26.64 
 
 
233 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.65 
 
 
331 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  31.16 
 
 
292 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.69 
 
 
350 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  25.5 
 
 
406 aa  63.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
335 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  25.22 
 
 
277 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.54 
 
 
298 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.23 
 
 
233 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  30.15 
 
 
331 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.98 
 
 
321 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.8 
 
 
325 aa  62  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.79 
 
 
240 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
504 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.9 
 
 
334 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.19 
 
 
298 aa  60.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  30.35 
 
 
354 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.76 
 
 
233 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  28.57 
 
 
417 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  23.83 
 
 
289 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>