175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3619 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  70.36 
 
 
705 aa  904    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  69.9 
 
 
704 aa  909    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  70.08 
 
 
701 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  66.77 
 
 
699 aa  862    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
727 aa  1397    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  48.26 
 
 
743 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  52.25 
 
 
702 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  42.47 
 
 
758 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  41.64 
 
 
696 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  35.98 
 
 
703 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  35.82 
 
 
715 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  38.36 
 
 
715 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  34.77 
 
 
714 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  36.79 
 
 
692 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  38.17 
 
 
715 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  38.61 
 
 
714 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
708 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  35.11 
 
 
719 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  34.42 
 
 
713 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  32.89 
 
 
716 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  34.51 
 
 
749 aa  364  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.16 
 
 
764 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
712 aa  348  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  35.2 
 
 
726 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  33.2 
 
 
764 aa  347  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  34.87 
 
 
752 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  33.48 
 
 
764 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  31.69 
 
 
788 aa  336  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  34.36 
 
 
687 aa  336  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  32.46 
 
 
787 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  35.23 
 
 
728 aa  323  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  31.26 
 
 
763 aa  306  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  35.24 
 
 
681 aa  301  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  34.06 
 
 
710 aa  297  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  34.12 
 
 
710 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  33.91 
 
 
710 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  34.12 
 
 
710 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  33.28 
 
 
713 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.44 
 
 
727 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  31.93 
 
 
886 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  31.2 
 
 
897 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  30.2 
 
 
873 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  29.62 
 
 
873 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  32.21 
 
 
872 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  31.97 
 
 
884 aa  260  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  32.06 
 
 
872 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  31.07 
 
 
887 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.07 
 
 
887 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  43.29 
 
 
625 aa  231  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  30.69 
 
 
480 aa  90.5  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.82 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  29.51 
 
 
453 aa  72  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.53 
 
 
290 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  33.33 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.68 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.8 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  31.73 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  31.73 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.73 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.73 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
357 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  32.8 
 
 
357 aa  66.6  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.31 
 
 
328 aa  66.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.22 
 
 
356 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.8 
 
 
357 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.67 
 
 
294 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.75 
 
 
358 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.38 
 
 
368 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.27 
 
 
591 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.38 
 
 
507 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.79 
 
 
331 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.28 
 
 
331 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.13 
 
 
351 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  31.88 
 
 
406 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
347 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.53 
 
 
356 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  33.91 
 
 
354 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  26.09 
 
 
277 aa  60.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  29.61 
 
 
480 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.28 
 
 
229 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.01 
 
 
288 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  28.64 
 
 
290 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.33 
 
 
258 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
356 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0126  iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
325 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.59 
 
 
645 aa  58.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.67 
 
 
298 aa  58.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  28.73 
 
 
263 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.06 
 
 
243 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.44 
 
 
240 aa  57.8  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  24.73 
 
 
289 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  24.73 
 
 
289 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  24.73 
 
 
289 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  28.46 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  28.12 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.71 
 
 
325 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  28.02 
 
 
233 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.27 
 
 
233 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  33.15 
 
 
281 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  30.08 
 
 
285 aa  54.7  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>