189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1482 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  69.78 
 
 
872 aa  1165    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  55.92 
 
 
710 aa  787    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
886 aa  1793    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  55.97 
 
 
884 aa  957    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  56.21 
 
 
710 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  70.48 
 
 
727 aa  1009    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  54.8 
 
 
713 aa  782    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  69.09 
 
 
897 aa  1209    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  70.25 
 
 
872 aa  1184    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  71.35 
 
 
873 aa  1256    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  55.92 
 
 
710 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  56.07 
 
 
710 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  69.19 
 
 
887 aa  1169    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  71.7 
 
 
873 aa  1259    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  69.19 
 
 
887 aa  1169    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  37.43 
 
 
719 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  36.19 
 
 
714 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  37.23 
 
 
715 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  37.23 
 
 
715 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  35.92 
 
 
714 aa  416  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  36.43 
 
 
712 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  34.76 
 
 
716 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  35.92 
 
 
713 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  33.79 
 
 
764 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  34.92 
 
 
764 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  35.03 
 
 
764 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
708 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  34.26 
 
 
749 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  35.06 
 
 
787 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  32.88 
 
 
752 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
788 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  34.53 
 
 
726 aa  357  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.95 
 
 
728 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  33.76 
 
 
763 aa  337  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  34.12 
 
 
687 aa  336  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  30.76 
 
 
703 aa  322  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  31.25 
 
 
715 aa  307  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  31.71 
 
 
743 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  32.7 
 
 
681 aa  297  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  32.86 
 
 
692 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  31.53 
 
 
701 aa  293  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  31.59 
 
 
704 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  32.19 
 
 
702 aa  284  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  31.88 
 
 
705 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  31.49 
 
 
699 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  27.79 
 
 
758 aa  238  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.2 
 
 
696 aa  225  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  40.52 
 
 
625 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
727 aa  214  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0662  hypothetical protein  60 
 
 
141 aa  155  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.63 
 
 
480 aa  94  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.8 
 
 
233 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.08 
 
 
288 aa  88.2  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.48 
 
 
233 aa  88.2  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  27.47 
 
 
233 aa  88.2  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.12 
 
 
229 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.25 
 
 
277 aa  82  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.29 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.38 
 
 
294 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  25.86 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  25.86 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.13 
 
 
240 aa  76.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.86 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.86 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.16 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.86 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  25.86 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.43 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  27.31 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  25.99 
 
 
406 aa  73.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.72 
 
 
356 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.14 
 
 
444 aa  73.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  30.43 
 
 
431 aa  73.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  33.14 
 
 
437 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  29.07 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.53 
 
 
356 aa  72  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  28.85 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.43 
 
 
357 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.19 
 
 
285 aa  70.1  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.69 
 
 
356 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.65 
 
 
247 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.1 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  24.87 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.16 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.53 
 
 
181 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.08 
 
 
331 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.32 
 
 
334 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.58 
 
 
368 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.88 
 
 
591 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.32 
 
 
347 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  29.93 
 
 
360 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.55 
 
 
331 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.91 
 
 
325 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.12 
 
 
299 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.93 
 
 
335 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.32 
 
 
282 aa  64.3  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.21 
 
 
307 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0472  iron-sulfur cluster-binding protein  27.98 
 
 
257 aa  63.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.83 
 
 
368 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>