181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1073 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  62.92 
 
 
714 aa  889    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  47.98 
 
 
719 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  48.35 
 
 
716 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
712 aa  1454    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  52.15 
 
 
715 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  47.47 
 
 
708 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  52.65 
 
 
714 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  48.05 
 
 
713 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  51.86 
 
 
715 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  44.9 
 
 
764 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  44.87 
 
 
764 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  43.09 
 
 
764 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  44.28 
 
 
787 aa  611  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  45.04 
 
 
788 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  43.98 
 
 
752 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
749 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  44.43 
 
 
726 aa  575  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  42.07 
 
 
763 aa  568  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  43.78 
 
 
728 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  39.29 
 
 
687 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  39.03 
 
 
713 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  38.82 
 
 
710 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  37.65 
 
 
703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  38.68 
 
 
710 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  38.68 
 
 
710 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  38.82 
 
 
710 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  37.25 
 
 
884 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  38.24 
 
 
873 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  35.8 
 
 
692 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  37.79 
 
 
873 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  35.77 
 
 
715 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  38.17 
 
 
727 aa  432  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
681 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  35.68 
 
 
897 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  37.76 
 
 
872 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  36.43 
 
 
886 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  35.31 
 
 
743 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  38.05 
 
 
887 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  38.05 
 
 
887 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  37.91 
 
 
872 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  62.26 
 
 
625 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  37.17 
 
 
702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  34 
 
 
758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
699 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  34.29 
 
 
704 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  34.22 
 
 
701 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  34.6 
 
 
705 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  32.33 
 
 
696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
727 aa  300  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.02 
 
 
480 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.85 
 
 
357 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.41 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.85 
 
 
357 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.85 
 
 
357 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.41 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  30.85 
 
 
357 aa  86.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  30.85 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.69 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.29 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.15 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.61 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  27.78 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  29.82 
 
 
572 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.32 
 
 
233 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.6 
 
 
368 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.32 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.5 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  26.91 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  27.15 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.89 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.52 
 
 
591 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.06 
 
 
404 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  26.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.23 
 
 
347 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.8 
 
 
404 aa  65.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.05 
 
 
260 aa  65.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  27.76 
 
 
373 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.61 
 
 
273 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30 
 
 
299 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 
404 aa  63.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.06 
 
 
325 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.52 
 
 
351 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  26.32 
 
 
270 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.83 
 
 
294 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.65 
 
 
350 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.1 
 
 
331 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  27.8 
 
 
277 aa  62  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.23 
 
 
404 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.09 
 
 
307 aa  61.6  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 
358 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
331 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.02 
 
 
233 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 
356 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.35 
 
 
228 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.39 
 
 
288 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
404 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.16 
 
 
321 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>