163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1429 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  67.79 
 
 		 719 aa  1005    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  72.85 
 
 		 716 aa  1068    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  47.21 
 
 		 712 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  49.92 
 
 		 715 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  49.41 
 
 		 714 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 708 aa  1464    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  50.52 
 
 		 714 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  75.15 
 
 		 713 aa  1090    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  49.62 
 
 		 715 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  42.2 
 
 		 764 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  42.08 
 
 		 764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  41.93 
 
 		 787 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  41.24 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  40.52 
 
 		 764 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 788 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 749 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 726 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  39.83 
 
 		 763 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  40.93 
 
 		 728 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  34.38 
 
 		 687 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 681 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  36.38 
 
 		 884 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  33.53 
 
 		 743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  34.21 
 
 		 873 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 873 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  34.4 
 
 		 703 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  35 
 
 		 710 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  35 
 
 		 710 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  35.58 
 
 		 713 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  34.9 
 
 		 710 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  34.85 
 
 		 710 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  34.58 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 886 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  34.9 
 
 		 872 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  33.14 
 
 		 727 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  34.76 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  34.46 
 
 		 872 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  34.39 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  32.4 
 
 		 699 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  34.02 
 
 		 887 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  33.48 
 
 		 897 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  34.02 
 
 		 887 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  32.16 
 
 		 704 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 705 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  32.05 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 758 aa  357  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  51.76 
 
 		 625 aa  350  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  30.68 
 
 		 696 aa  316  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 727 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.52 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  30.54 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.11 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.91 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.29 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.06 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.71 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  31.9 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  27.6 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.72 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  30.64 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  27.4 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.64 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  29.36 
 
 		 406 aa  62  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.5 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  26.67 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.58 
 
 		 404 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 356 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.19 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  29.5 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.74 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  28.35 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  23.08 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.77 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  27.81 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.73 
 
 		 350 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.58 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 260 aa  57.4  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  28.19 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  27.66 
 
 		 386 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.18 
 
 		 228 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 404 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.73 
 
 		 298 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 282 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29.19 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>