194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2862 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
749 aa  1518    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  63.76 
 
 
787 aa  976    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  68.99 
 
 
764 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  65.54 
 
 
752 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  67.38 
 
 
764 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  52.62 
 
 
726 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  71.33 
 
 
764 aa  1102    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  60.76 
 
 
763 aa  918    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  51.46 
 
 
728 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  62.06 
 
 
788 aa  973    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  43.71 
 
 
714 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  45.24 
 
 
714 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  44.71 
 
 
715 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  45.18 
 
 
715 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  43.62 
 
 
712 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  40.92 
 
 
708 aa  549  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  39.78 
 
 
719 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  41 
 
 
716 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  39.8 
 
 
713 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  41.96 
 
 
687 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  39.51 
 
 
681 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  37.02 
 
 
710 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  37.11 
 
 
710 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  36.06 
 
 
713 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  37.11 
 
 
710 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  37.25 
 
 
710 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
703 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  34.91 
 
 
715 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  34.39 
 
 
886 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  34.85 
 
 
727 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  36.07 
 
 
692 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  34.15 
 
 
884 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
873 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  33.51 
 
 
873 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  33.82 
 
 
743 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  34.6 
 
 
704 aa  363  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  35.11 
 
 
872 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  34.6 
 
 
705 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  34.3 
 
 
872 aa  357  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  34.95 
 
 
701 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  33.38 
 
 
887 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  33.38 
 
 
887 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  33.92 
 
 
699 aa  343  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  32.44 
 
 
897 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  45.07 
 
 
625 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  30.84 
 
 
758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.87 
 
 
702 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3619  FMN-binding domain-containing protein  34.96 
 
 
727 aa  297  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  normal  0.107626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  38.67 
 
 
696 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.34 
 
 
480 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.18 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.27 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  31.48 
 
 
357 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  31.48 
 
 
357 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.48 
 
 
357 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.48 
 
 
357 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.48 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.02 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  31.02 
 
 
357 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  31.02 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.02 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.49 
 
 
229 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.32 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.55 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.7 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  28.38 
 
 
233 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.38 
 
 
233 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.16 
 
 
368 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  28.16 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.09 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.34 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.78 
 
 
591 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.52 
 
 
356 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.08 
 
 
350 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.81 
 
 
358 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.87 
 
 
356 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  28.64 
 
 
261 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  28.32 
 
 
334 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.93 
 
 
404 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.43 
 
 
325 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.97 
 
 
404 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  23.17 
 
 
373 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.79 
 
 
181 aa  62  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  30.96 
 
 
391 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 
294 aa  62  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.45 
 
 
507 aa  61.6  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 
453 aa  61.6  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1279  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.92 
 
 
315 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  29.19 
 
 
397 aa  60.8  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  30.22 
 
 
572 aa  60.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.09 
 
 
404 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  26.9 
 
 
360 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.38 
 
 
331 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.81 
 
 
397 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  30.27 
 
 
397 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  29.29 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.23 
 
 
247 aa  59.3  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 
404 aa  59.3  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 
504 aa  58.9  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>