144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1623 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  100 
 
 		 396 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  29.51 
 
 		 638 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  27.93 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  30.77 
 
 		 480 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  31.02 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.84 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  29.39 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  28.42 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  27.98 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  27.08 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  28.71 
 
 		 969 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  26.56 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  26.4 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  27.71 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  23.15 
 
 		 572 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  23.89 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  27.92 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  25.54 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.87 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  24.19 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  24.45 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  28.3 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 726 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 714 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  28.8 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  28.49 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  28.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 886 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.92 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.49 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  27.4 
 
 		 716 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 708 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  30.17 
 
 		 704 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.32 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  26.87 
 
 		 714 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  27.03 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.92 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  28.76 
 
 		 710 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  28.76 
 
 		 710 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.71 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.84 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 713 aa  59.7  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  28.05 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  30.6 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.22 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  32.58 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  29.05 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  26.8 
 
 		 710 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 703 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  25.97 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.1 
 
 		 196 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  28.1 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.15 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  27.45 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  27.23 
 
 		 764 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  28.22 
 
 		 787 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  30 
 
 		 873 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  28.22 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 788 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  30 
 
 		 873 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.89 
 
 		 728 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.06 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  27.14 
 
 		 752 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  28.04 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  30.58 
 
 		 884 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  26.78 
 
 		 887 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 749 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  26.78 
 
 		 887 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.68 
 
 		 193 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  30.61 
 
 		 298 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  25.97 
 
 		 764 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.72 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.01 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  29.67 
 
 		 692 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.26 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.61 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  26.23 
 
 		 872 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  25.82 
 
 		 743 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.61 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.61 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  31.28 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  28.93 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>