98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1480 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  91.91 
 
 		 383 aa  713    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  90.15 
 
 		 396 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  100 
 
 		 399 aa  810    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  39.4 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  42.46 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  42.51 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  42.51 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  41.9 
 
 		 572 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  41.89 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  35.22 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  32.34 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  31.47 
 
 		 480 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.9 
 
 		 453 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  30.49 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  29.59 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  26.68 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  31.5 
 
 		 969 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  27.9 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  29.31 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  25.89 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  26.6 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  25.53 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  30.88 
 
 		 764 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  26.84 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 714 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  24.4 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  31.62 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 873 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  32.12 
 
 		 872 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  26.99 
 
 		 726 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  29.12 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.11 
 
 		 687 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  30.37 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  27.78 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  32.54 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  31.16 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.16 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  28 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.33 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 703 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 886 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  31.75 
 
 		 715 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  25.48 
 
 		 763 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  25.48 
 
 		 787 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 788 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  30.33 
 
 		 897 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  25.5 
 
 		 749 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  29.19 
 
 		 708 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 712 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 713 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  29.93 
 
 		 727 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  27.75 
 
 		 714 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  31.51 
 
 		 716 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  28.17 
 
 		 713 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 758 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  27.66 
 
 		 710 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  27.46 
 
 		 710 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  27.46 
 
 		 710 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  26.2 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.2 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  27.46 
 
 		 710 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.86 
 
 		 764 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  28.22 
 
 		 704 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.29 
 
 		 728 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.96 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  25.95 
 
 		 884 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.15 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  26.99 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  24.08 
 
 		 702 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  23.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  26.01 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  23.5 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 705 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  23.5 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.5 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.24 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.52 
 
 		 258 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.67 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  23.92 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  24.14 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.42 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  29 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  29.13 
 
 		 201 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.97 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  26.77 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.81 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.56 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.94 
 
 		 580 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.6 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  25.41 
 
 		 233 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 233 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>