92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0698 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  100 
 
 
360 aa  742    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  31.16 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  28.92 
 
 
480 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  29.94 
 
 
391 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.62 
 
 
453 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  28.44 
 
 
373 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  28.87 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  25.38 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  28.66 
 
 
969 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  25.22 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  27.9 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  26.67 
 
 
393 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  29.55 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  25.98 
 
 
572 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  26.63 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  25.76 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  24.48 
 
 
397 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  29.39 
 
 
396 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  25.44 
 
 
397 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  24.02 
 
 
397 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  23.93 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  25.73 
 
 
726 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  26.04 
 
 
719 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  22.85 
 
 
638 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  29.9 
 
 
743 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  29.11 
 
 
872 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
886 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  24.66 
 
 
714 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  28.48 
 
 
872 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  27.89 
 
 
713 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.7 
 
 
728 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  27.5 
 
 
873 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
873 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  24.43 
 
 
714 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  23.93 
 
 
787 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  23.21 
 
 
763 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  22.89 
 
 
703 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  28.07 
 
 
788 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  27.85 
 
 
887 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  27.85 
 
 
887 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  29.14 
 
 
897 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
749 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.63 
 
 
764 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  27.81 
 
 
708 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  28.26 
 
 
764 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  25.47 
 
 
716 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  30.36 
 
 
687 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  24.31 
 
 
699 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  29.03 
 
 
752 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  26.26 
 
 
681 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  24.4 
 
 
625 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  25.52 
 
 
710 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  25.52 
 
 
710 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  27.66 
 
 
727 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  25 
 
 
480 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.99 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  26.85 
 
 
713 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  23.56 
 
 
712 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  25.57 
 
 
884 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  24.14 
 
 
764 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.05 
 
 
444 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  29.13 
 
 
704 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  28.24 
 
 
715 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  27.18 
 
 
692 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  26.17 
 
 
710 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  24.83 
 
 
710 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  28.46 
 
 
701 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  26.06 
 
 
715 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28 
 
 
247 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.68 
 
 
299 aa  49.7  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  23.14 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  26.02 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  25.69 
 
 
715 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.98 
 
 
696 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  28.02 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.15 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  30.99 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.47 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  28.65 
 
 
298 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.69 
 
 
298 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.21 
 
 
580 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.7 
 
 
181 aa  46.2  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0300  hypothetical protein  22.27 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  28.66 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.03 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.09 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  26.12 
 
 
431 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  28.37 
 
 
212 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  28.1 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  26.29 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.36 
 
 
177 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  25.36 
 
 
233 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>