102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0738 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 392 aa  800    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  65.35 
 
 		 393 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  47.54 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  37.19 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  36.8 
 
 		 969 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  31.89 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  30.51 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  32.74 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  34.56 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  30.83 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  31.47 
 
 		 572 aa  169  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  31.18 
 
 		 383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.62 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  28.32 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29.21 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  30.23 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  26.02 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  25.38 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  30.42 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  26.28 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 886 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  23.56 
 
 		 638 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  27.32 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 703 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  25.57 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  24.88 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  27.32 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  31.05 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  33.55 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.57 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 873 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 749 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  24.46 
 
 		 713 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  26.57 
 
 		 787 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  31.36 
 
 		 173 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  26.32 
 
 		 185 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  32.03 
 
 		 873 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  31.36 
 
 		 173 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  23.68 
 
 		 719 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.12 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.97 
 
 		 764 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  26.57 
 
 		 763 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 788 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  30.43 
 
 		 625 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  29.33 
 
 		 713 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  26.76 
 
 		 884 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  27.13 
 
 		 752 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  28.04 
 
 		 764 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  28.39 
 
 		 872 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  32.05 
 
 		 897 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  31.61 
 
 		 887 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.61 
 
 		 887 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  39.47 
 
 		 171 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  28 
 
 		 710 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 714 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.83 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  28 
 
 		 710 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  28 
 
 		 710 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  28 
 
 		 710 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  31.85 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.62 
 
 		 727 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  25.56 
 
 		 743 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.07 
 
 		 177 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1884  putative regulatory protein NosR  28.42 
 
 		 715 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  25.1 
 
 		 714 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  27.09 
 
 		 702 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  29.51 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  30.77 
 
 		 168 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  31.58 
 
 		 182 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.6 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  26.39 
 
 		 716 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.31 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.79 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  31.91 
 
 		 195 aa  46.2  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  39.13 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  27.82 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  22.03 
 
 		 758 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  25.4 
 
 		 701 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.36 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.37 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  29.37 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  25 
 
 		 696 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  25.53 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.38 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.03 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.51 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.94 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.53 
 
 		 200 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  21.63 
 
 		 764 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.35 
 
 		 181 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 233 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.22 
 
 		 185 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 149 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.21 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>