123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  100 
 
 
316 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.35 
 
 
338 aa  330  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.06 
 
 
332 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  46.15 
 
 
313 aa  246  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06180  polyferredoxin  41.8 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91995  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.05 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.080785  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  39.16 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.39 
 
 
209 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.1 
 
 
318 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.57 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  25.73 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  23.05 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  25.45 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.16 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  25.48 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  23.27 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  24.62 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  25.2 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0479  hypothetical protein  38.2 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.44 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  24.05 
 
 
275 aa  62.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  24.9 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  25.29 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.79 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.34 
 
 
507 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.77 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.34 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00763219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  24.71 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  23.87 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.51 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  24.54 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.7 
 
 
281 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.41 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  28.67 
 
 
281 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  20.7 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  25.68 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  25.2 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  25.7 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  25.7 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  26.45 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  25.97 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  26.1 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  21.31 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.53 
 
 
290 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.31 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  24.9 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.36 
 
 
444 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  24.9 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  22.22 
 
 
480 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  24.9 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  24.9 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  24.51 
 
 
287 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  24.51 
 
 
287 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  24.51 
 
 
287 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22.06 
 
 
299 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  24.18 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  24.51 
 
 
287 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  25.68 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.71 
 
 
504 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  23.55 
 
 
743 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  24.51 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  24.62 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  24.9 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  27 
 
 
758 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.6 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  31.93 
 
 
518 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  22.02 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  23.29 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.71 
 
 
510 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  24.43 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  24.51 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.49 
 
 
539 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.79 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.44 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  26.39 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.78 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.38 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.64 
 
 
347 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  23.04 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  21.33 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  23.5 
 
 
431 aa  46.2  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  22 
 
 
233 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 
272 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  24.24 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  24.62 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  25.34 
 
 
788 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  24.22 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.68 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.79 
 
 
764 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  21.94 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  25.47 
 
 
764 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  24.91 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.91 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.57 
 
 
233 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.91 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.91 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>