72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1009 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 436 aa  858    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  32.89 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.18 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  32.2 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.03 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  22.62 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  29.34 
 
 		 285 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 		 288 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.33 
 
 		 279 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  29.41 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  21.95 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  32.95 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.14 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.06 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 645 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 656 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.05 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 860 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  32.38 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  25.61 
 
 		 275 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  37.31 
 
 		 713 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  28.23 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  37.31 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  37.31 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  37.31 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  37.31 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  30.43 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.35 
 
 		 338 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  27.54 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 857 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  27.36 
 
 		 323 aa  46.6  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.65 
 
 		 504 aa  46.6  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.73 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  31.46 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22.96 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.71 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  34.33 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  31.18 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  35.82 
 
 		 887 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0165  hypothetical protein  36.62 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.46 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  35.82 
 
 		 887 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  27.03 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.33 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 232 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  24.86 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.69 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.14 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 		 334 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  28.1 
 
 		 463 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  37.14 
 
 		 743 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  31.19 
 
 		 289 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  35.06 
 
 		 205 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  34.85 
 
 		 884 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  46.3 
 
 		 215 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  24.86 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  24.86 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.78 
 
 		 55 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  25.86 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.79 
 
 		 296 aa  43.5  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  31.78 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  34.33 
 
 		 872 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  33.77 
 
 		 787 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>