94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0525 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 438 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 539 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  42.11 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  40.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.77 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.49 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  26.74 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  24.28 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.35 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.96 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.25 
 
 		 238 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  34.04 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.04 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  28.06 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 		 298 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 288 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  26.02 
 
 		 275 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.46 
 
 		 368 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 591 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  31.11 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.26 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.92 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  27.09 
 
 		 710 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  27.09 
 
 		 710 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.47 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.41 
 
 		 277 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.53 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  25.27 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  28.5 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33 
 
 		 273 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 314 aa  46.6  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.28 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  31.63 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  31.31 
 
 		 713 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  31.63 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  23.78 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4404  iron-sulfur cluster-binding protein  30.77 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.38 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.06 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  32.14 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  22.8 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  24.29 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.63 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.89 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.38 
 
 		 240 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  35.14 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  28.87 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 		 320 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.03 
 
 		 228 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.17 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.65 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  35.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  27.75 
 
 		 860 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.66 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  29.21 
 
 		 287 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  30.14 
 
 		 276 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  27.87 
 
 		 302 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.3 
 
 		 55 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  30.77 
 
 		 727 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.3 
 
 		 55 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27 
 
 		 480 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 961 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 963 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 645 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  28.24 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.72 
 
 		 656 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1518  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 132 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>