18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2525 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  51.46 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  50.49 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  49.54 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  47.71 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  46.79 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  47.71 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  46.79 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  44.04 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  44.95 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  44.95 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  44.95 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  42.2 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  37.38 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  29.52 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  36.17 
 
 		 438 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>