16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1851 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  97.48 
 
 
119 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  97.48 
 
 
119 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  95.8 
 
 
119 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  59.66 
 
 
119 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  52.68 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  55.24 
 
 
115 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  55.24 
 
 
115 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  50.86 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  49.09 
 
 
114 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  46.49 
 
 
114 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  48.65 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  46.36 
 
 
111 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  44.95 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  35.78 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  41.44 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>