19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1725 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  222  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  88.39 
 
 
115 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  88.39 
 
 
115 aa  197  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  79.82 
 
 
114 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  67.57 
 
 
119 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  52.29 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  53.57 
 
 
119 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  52.68 
 
 
119 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  52.68 
 
 
119 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  49.53 
 
 
111 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  52.68 
 
 
119 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  50.45 
 
 
112 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  46.79 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  48.62 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  38.38 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  35.79 
 
 
438 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  33.04 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 
452 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>