67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2389 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 452 aa  869    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 539 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  45.09 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.22 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.16 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.34 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  25.13 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  33.61 
 
 		 119 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  28.25 
 
 		 301 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.58 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.58 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.58 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.13 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.58 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.94 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  27.27 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27.63 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.34 
 
 		 272 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.26 
 
 		 656 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.23 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  34.62 
 
 		 303 aa  47  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  24.59 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0718  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  26.67 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  28.12 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  24.27 
 
 		 918 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  25.76 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  28.12 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  28.12 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.09 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  28.12 
 
 		 710 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.55 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  26.06 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.4 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.89 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.88 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  26.98 
 
 		 277 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  20.81 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  36.56 
 
 		 114 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  23.7 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.3 
 
 		 257 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  29.36 
 
 		 633 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.46 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  21.92 
 
 		 259 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.3 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.3 
 
 		 327 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  21.92 
 
 		 259 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.06 
 
 		 285 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  18.3 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  33.33 
 
 		 270 aa  43.9  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 		 258 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 		 860 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  28.38 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  23.75 
 
 		 275 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.02 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.79 
 
 		 273 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>