17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1546 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  53.98 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  52.29 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  49.54 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  44.25 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  43.12 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  45.22 
 
 		 115 aa  87  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  45.22 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  41.59 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  39.82 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  45.95 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  45.95 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  45.05 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  45.05 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  31.48 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  33.62 
 
 		 438 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>