16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2613 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  97.48 
 
 
119 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  93.28 
 
 
119 aa  206  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  58.82 
 
 
119 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  53.57 
 
 
115 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  53.64 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  54.13 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  53.7 
 
 
114 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  46.49 
 
 
114 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  48.18 
 
 
114 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  48.65 
 
 
112 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  46.36 
 
 
111 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  45.63 
 
 
109 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  35.78 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  40.54 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>