17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0726 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  36.7 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  36.11 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  38.38 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  37.38 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  38.38 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  37.37 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  32.11 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  36.7 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  37.61 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  38.04 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  35.78 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  35.78 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  29.46 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  31.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>