18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1581 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  98.26 
 
 		 115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  88.39 
 
 		 115 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  80.53 
 
 		 114 aa  180  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  71.43 
 
 		 119 aa  156  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  50.46 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  55.05 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  50.48 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  54.13 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  55.24 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  51.46 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  52.38 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  50.45 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  47.71 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  37.37 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  45.22 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  32.29 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  35.79 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>