18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1947 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1725  hypothetical protein  79.82 
 
 		 115 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1656  hypothetical protein  84.91 
 
 		 115 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.033888  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1581  hypothetical protein  80.53 
 
 		 115 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2254  hypothetical protein  62.5 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1795  hypothetical protein  49.55 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1851  hypothetical protein  50.86 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419353  hitchhiker  0.000250305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2613  hypothetical protein  53.7 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2344  hypothetical protein  50.48 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2493  hypothetical protein  52.78 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.42543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2500  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2525  hypothetical protein  48.15 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2800  hypothetical protein  47.71 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.939106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1750  hypothetical protein  45.28 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0726  membrane protein  36.11 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1546  hypothetical protein  39.82 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0929269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  30.43 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1642  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>