More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0556 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  68.35 
 
 
283 aa  357  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  52.88 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  53.02 
 
 
302 aa  308  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  52.4 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  55.63 
 
 
302 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  48.53 
 
 
298 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  45.3 
 
 
289 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  45.3 
 
 
289 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  44.95 
 
 
289 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  51.29 
 
 
281 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  48.2 
 
 
285 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  47.91 
 
 
302 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  48.19 
 
 
323 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  50.19 
 
 
299 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  44.03 
 
 
292 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  48.36 
 
 
319 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  47.86 
 
 
284 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  49.11 
 
 
287 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  45.2 
 
 
287 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  45.2 
 
 
287 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  46.1 
 
 
303 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  44.84 
 
 
287 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  47.23 
 
 
327 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  47.6 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  44.84 
 
 
287 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  44.84 
 
 
287 aa  258  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  44.84 
 
 
287 aa  258  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  44.84 
 
 
287 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  44.84 
 
 
287 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  47.23 
 
 
332 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  49.11 
 
 
287 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  44.84 
 
 
287 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  41.94 
 
 
290 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  45.49 
 
 
283 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  42.21 
 
 
275 aa  229  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  42.49 
 
 
279 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  35.38 
 
 
263 aa  176  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  34.24 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  37.6 
 
 
272 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  36.36 
 
 
263 aa  159  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  30.5 
 
 
261 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  37.31 
 
 
263 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  34.72 
 
 
298 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.57 
 
 
298 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 
259 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 
259 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.62 
 
 
299 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  34.63 
 
 
292 aa  135  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  32.4 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  32.11 
 
 
301 aa  132  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.72 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.5 
 
 
470 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.41 
 
 
407 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.8 
 
 
407 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.63 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  28.08 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.9 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.29 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  26.24 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.89 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27.57 
 
 
480 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1336  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  29.06 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  25.56 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000640638  hitchhiker  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.88 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.46 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  26.45 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1174  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.29 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  27.37 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1234  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.92 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  25.19 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.19 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0273  iron-sulfur cluster-binding protein  23.26 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.19 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  25.19 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.41 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4223  cytochrome c oxidase cbb3 type accessory protein FixG  27.06 
 
 
473 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000139673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.81 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.91 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.2 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  25.19 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.19 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.41 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1810  polyferredoxin-like protein  29.1 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.56 
 
 
591 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2078  polyferredoxin-like protein  28.95 
 
 
367 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.833092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3633  iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 
474 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0085  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  23.85 
 
 
452 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000922183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.43 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2835  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.76 
 
 
512 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1281  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  25.23 
 
 
477 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.56 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  23.67 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4301  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  27.19 
 
 
475 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000277217  hitchhiker  0.000000000206454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>