70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1913 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1060    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  49.09 
 
 		 438 aa  359  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  48.44 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.3 
 
 		 435 aa  287  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.6 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.94 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  24.78 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  24.87 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 232 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  24.88 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.91 
 
 		 519 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  23.79 
 
 		 480 aa  53.9  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.53 
 
 		 273 aa  53.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.176539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.74 
 
 		 349 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.95 
 
 		 298 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.21 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 		 285 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  22.87 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.31 
 
 		 298 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.44 
 
 		 238 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.87 
 
 		 588 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 273 aa  50.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  28.44 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  27.12 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.65 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  25.61 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  30.49 
 
 		 316 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.29 
 
 		 288 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  25.51 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.34 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  21.03 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 325 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.8 
 
 		 314 aa  47.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  32.81 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  21.99 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  22.28 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.76 
 
 		 290 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  22.28 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  20.53 
 
 		 263 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.6 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  37.31 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.47 
 
 		 591 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.54 
 
 		 224 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.147143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 282 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.1 
 
 		 350 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0137531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.26 
 
 		 357 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  26.7 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  28.92 
 
 		 354 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  21.51 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 290 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  23.68 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 300 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00763219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.43 
 
 		 331 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  25.53 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  25.53 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.57 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1957  iron-sulfur cluster-binding protein  27.63 
 
 		 290 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.1 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.85 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  25 
 
 		 323 aa  43.5  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.82 
 
 		 321 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.45 
 
 		 247 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>