219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1341 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  100 
 
 
281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  64.94 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  60.36 
 
 
301 aa  334  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  60.89 
 
 
302 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  60 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  51.08 
 
 
298 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  53.65 
 
 
302 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  52.61 
 
 
285 aa  292  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  53.11 
 
 
303 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  53.48 
 
 
323 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  49.64 
 
 
290 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  54.81 
 
 
332 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  54.07 
 
 
327 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  53.87 
 
 
327 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  52.55 
 
 
299 aa  278  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  52.96 
 
 
319 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  47.67 
 
 
289 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  47.67 
 
 
289 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  47.31 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  51.29 
 
 
287 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  47.81 
 
 
284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  47.97 
 
 
287 aa  251  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  47.97 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  47.97 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  47.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  50.18 
 
 
287 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  45.59 
 
 
292 aa  247  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  50.92 
 
 
287 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  49.64 
 
 
283 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  39.86 
 
 
275 aa  219  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  41.18 
 
 
279 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  39.55 
 
 
263 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  44.22 
 
 
283 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  39.11 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  37.6 
 
 
261 aa  177  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  36.68 
 
 
259 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  36.29 
 
 
259 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  33.84 
 
 
261 aa  166  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  40.45 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  39.75 
 
 
272 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.2 
 
 
298 aa  148  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.6 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  32.58 
 
 
300 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  33.85 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.89 
 
 
327 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.06 
 
 
470 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  33.33 
 
 
292 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.18 
 
 
298 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.18 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.080785  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.32 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.73 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.08 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.61 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.12 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.46 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.54 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.83 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.83 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.95 
 
 
407 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.26 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.76 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1810  polyferredoxin-like protein  22.84 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1359  polyferredoxin-like  24.05 
 
 
381 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.71 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  25.1 
 
 
367 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  26.7 
 
 
480 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2078  polyferredoxin-like protein  23.08 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.833092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.15 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.96 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.92 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  25.17 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.7 
 
 
366 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.54 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.6 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  27.78 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0556  iron-sulfur cluster-binding protein  23.13 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.850288  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  26.54 
 
 
701 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  25.7 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  27.85 
 
 
357 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.77 
 
 
591 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.44 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0642  Polyferredoxin-like protein  26.84 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000712923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  25.53 
 
 
346 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  26.36 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.36 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.77 
 
 
357 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.77 
 
 
357 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.77 
 
 
357 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.77 
 
 
357 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  25 
 
 
431 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.1 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  22.84 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0717  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.23 
 
 
472 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165472  normal  0.339839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>