185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06180  polyferredoxin  100 
 
 
299 aa  603  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91995  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.37 
 
 
332 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.07 
 
 
301 aa  264  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.080785  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.88 
 
 
338 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  42.77 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  44.04 
 
 
303 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.04 
 
 
294 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22780  polyferredoxin  46.33 
 
 
313 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.62 
 
 
209 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.75 
 
 
318 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0479  hypothetical protein  51.06 
 
 
101 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.3 
 
 
470 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  28.79 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.49 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  26.64 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  27.82 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.31 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  27.05 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.36 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.97 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.25 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.72 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.29 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00763219  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  28.35 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  26.56 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  29.43 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  27.8 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  26.52 
 
 
480 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.01 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  24.92 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  25 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.69 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  24.65 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.32 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  25.68 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.39 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  25.68 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  25.68 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  25.78 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.62 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.8 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  26.58 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  23.08 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  24.44 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  27.24 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  26.58 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  26.42 
 
 
233 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.06 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  26.85 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.11 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.83 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  26.85 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  24.4 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.5 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  37.65 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.34 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.27 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  24.83 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  23.97 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.69 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  26.85 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.04 
 
 
507 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.27 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.79 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  26.46 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.62 
 
 
591 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.22 
 
 
233 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  25.69 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  22.97 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.81 
 
 
415 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.83 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  26.67 
 
 
386 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  23.55 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.34 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1141  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.12 
 
 
205 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.319505  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  23.02 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.85 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.63 
 
 
404 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  25.43 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  27.24 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.49 
 
 
404 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  25.24 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  22.82 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.43 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1359  polyferredoxin-like  24.1 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.73 
 
 
404 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>