More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0555 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  47.49 
 
 
289 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  47.49 
 
 
289 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  47.49 
 
 
289 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  45.9 
 
 
311 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  45.49 
 
 
287 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  42.54 
 
 
301 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  48.02 
 
 
302 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  42.32 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  42.57 
 
 
302 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  42.8 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  44.22 
 
 
281 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  44.32 
 
 
283 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  39.85 
 
 
292 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  46.69 
 
 
287 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  42.97 
 
 
327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  42.97 
 
 
327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  46.69 
 
 
287 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  42.97 
 
 
303 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  42.57 
 
 
299 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  45.39 
 
 
287 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  42.57 
 
 
332 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  40.87 
 
 
290 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  42.17 
 
 
323 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  46.3 
 
 
287 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  41.37 
 
 
319 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  44.4 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  46.72 
 
 
287 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  41.41 
 
 
279 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  40.78 
 
 
284 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  45.56 
 
 
287 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  35.02 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  36.15 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  35.16 
 
 
259 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  35.55 
 
 
259 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  36.96 
 
 
272 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  33.59 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  33.73 
 
 
261 aa  163  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  37.35 
 
 
263 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  36.19 
 
 
263 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  30.82 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.65 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.92 
 
 
298 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.49 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  31.94 
 
 
327 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.48 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.56 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.88 
 
 
470 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.75 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.54 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.89 
 
 
229 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.12 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.67 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16840  4Fe-4S protein  25.32 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34622  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.05 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  28.27 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  25.15 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.69 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.78 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0126  iron-sulfur cluster-binding protein  28.12 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.1 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.17 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.5 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.86 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1336  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.55 
 
 
409 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.75 
 
 
591 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.63 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1810  polyferredoxin-like protein  25.53 
 
 
367 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  28.82 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.23 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.12 
 
 
588 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.27 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.18 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.63 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1234  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 
409 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.04 
 
 
368 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1973  riboflavin biosynthesis protein ribAB  25.76 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.220327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  27.11 
 
 
417 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.96 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2763  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.61 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1174  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.55 
 
 
409 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.9 
 
 
332 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  25.81 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  23.98 
 
 
367 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.97 
 
 
479 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000640638  hitchhiker  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2078  polyferredoxin-like protein  23.3 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.833092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.73 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.25 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.73 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.64 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  25.64 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.44 
 
 
368 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>