41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0802 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  983    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  57.98 
 
 		 476 aa  362  6e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.11 
 
 		 641 aa  349  6e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.15 
 
 		 627 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 651 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 630 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.67 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 		 154 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  26.37 
 
 		 335 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.57 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0260  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 228 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 565 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 368 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1021  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.1 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.539735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.45 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.283108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0014  ferredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 		 108 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.935743  normal  0.0922438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 559 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 368 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0953  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 284 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  26.37 
 
 		 334 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 357 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  35.85 
 
 		 110 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2955  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00620817  normal  0.882488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>