43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1274 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  59.78 
 
 		 627 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 630 aa  1276    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.65 
 
 		 641 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.82 
 
 		 651 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.35 
 
 		 627 aa  123  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 		 476 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 489 aa  98.2  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  34.48 
 
 		 292 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.18 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  37.18 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  37.18 
 
 		 357 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  37.18 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  37.18 
 
 		 357 aa  51.6  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 357 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 357 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 96 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 96 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.18 
 
 		 334 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  33.68 
 
 		 633 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  31.18 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 96 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  25.35 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  25.35 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.54 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  25.35 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.05 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1466  iron-sulfur cluster-binding protein  29 
 
 		 344 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 		 331 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  27.27 
 
 		 474 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1052  iron-sulfur cluster-binding protein  33.78 
 
 		 339 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000925292  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  34.38 
 
 		 619 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2497  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 317 aa  44.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 		 739 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 205 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 404 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 329 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0751  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 328 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0839232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.66 
 
 		 443 aa  43.9  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>