30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2408 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 627 aa  1257    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.41 
 
 		 630 aa  777    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.25 
 
 		 651 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.6 
 
 		 641 aa  130  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.57 
 
 		 627 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 476 aa  90.5  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  25.36 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 		 316 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0751  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 328 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0839232  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  32.47 
 
 		 357 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  22.32 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  22.32 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  22.32 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  30.26 
 
 		 335 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 240 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1052  iron-sulfur cluster-binding protein  31.76 
 
 		 339 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000925292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  32.47 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.17 
 
 		 335 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.11 
 
 		 331 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 356 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32 
 
 		 334 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>