37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0578 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
627 aa  1255    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.23 
 
 
641 aa  639    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  44.23 
 
 
476 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.15 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.01 
 
 
651 aa  298  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.35 
 
 
630 aa  123  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  23.44 
 
 
627 aa  112  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.62 
 
 
366 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
470 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
158 aa  50.4  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2043  polysulfide reductase, subunit B, putative  34.48 
 
 
199 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.507681  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  32.56 
 
 
619 aa  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 
154 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0953  polysulfide reductase, subunit B, putative  32.58 
 
 
199 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.782237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  33.8 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
173 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0528  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  31.15 
 
 
1028 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.58 
 
 
334 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1336  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 
199 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 
96 aa  45.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0620  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.74 
 
 
201 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.615603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1021  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.18 
 
 
512 aa  45.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.539735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  36.54 
 
 
110 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
344 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.283108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3244  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.21 
 
 
238 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
252 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
279 aa  43.9  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0425642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1864  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 
199 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0333456 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05070  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  37.74 
 
 
205 aa  43.9  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
444 aa  43.9  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3934  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  34.85 
 
 
1125 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3086  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
263 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>