More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02718 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  99.09 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  99.09 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  98.18 
 
 		 162 aa  216  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  98.18 
 
 		 162 aa  216  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.18 
 
 		 162 aa  216  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  97.27 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50 
 
 		 653 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50 
 
 		 653 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50 
 
 		 653 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50 
 
 		 653 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.04 
 
 		 653 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  46.9 
 
 		 659 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  45.67 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  45.67 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.83 
 
 		 658 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.99 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.51 
 
 		 674 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.51 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  49.48 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  49.48 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.17 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  49.07 
 
 		 639 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  49.07 
 
 		 639 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  49.48 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.07 
 
 		 639 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.07 
 
 		 639 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.07 
 
 		 641 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.07 
 
 		 639 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  48.45 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.96 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.22 
 
 		 671 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.53 
 
 		 674 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.96 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  48.04 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.04 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  48.45 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  47.96 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  48.04 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.04 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.27 
 
 		 667 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.15 
 
 		 644 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.48 
 
 		 173 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.79 
 
 		 169 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  46.94 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.6 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.17 
 
 		 180 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.69 
 
 		 204 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.17 
 
 		 180 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  36.67 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  36.67 
 
 		 205 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  36.67 
 
 		 205 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  36.67 
 
 		 205 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 		 205 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  36.67 
 
 		 205 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  36.67 
 
 		 205 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.4 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  36.67 
 
 		 205 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.43 
 
 		 671 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.44 
 
 		 652 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.43 
 
 		 671 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  38.74 
 
 		 181 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 		 189 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.88 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  36.94 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  35.11 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  34.35 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  34.35 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>