More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0807 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  99.38 
 
 
162 aa  321  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  99.38 
 
 
162 aa  321  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  99.38 
 
 
162 aa  321  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  98.77 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  97.27 
 
 
110 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.68 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  43.86 
 
 
185 aa  150  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.94 
 
 
176 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.07 
 
 
185 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  44.07 
 
 
185 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  48.05 
 
 
157 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  48.05 
 
 
157 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.73 
 
 
177 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  48.05 
 
 
157 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.83 
 
 
169 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.86 
 
 
653 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.86 
 
 
653 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.5 
 
 
173 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  47.4 
 
 
157 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.86 
 
 
653 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.5 
 
 
176 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  44.58 
 
 
659 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.86 
 
 
653 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.58 
 
 
659 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.41 
 
 
157 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.41 
 
 
157 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  46.41 
 
 
157 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.54 
 
 
658 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.81 
 
 
674 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  46.75 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.22 
 
 
653 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  45.86 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.86 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  45.86 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.86 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  45.75 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.16 
 
 
674 aa  137  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.79 
 
 
667 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.36 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  45.4 
 
 
639 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.64 
 
 
671 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.4 
 
 
639 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.4 
 
 
639 aa  133  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  45.4 
 
 
639 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.68 
 
 
639 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.4 
 
 
641 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  40.72 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  40.72 
 
 
181 aa  131  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.48 
 
 
176 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  40.12 
 
 
175 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  39.52 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  39.52 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  39.52 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.17 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  39.52 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  39.52 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.08 
 
 
671 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.08 
 
 
671 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.59 
 
 
202 aa  120  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.8 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.14 
 
 
205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  36.14 
 
 
205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  36.14 
 
 
205 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.14 
 
 
205 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  36.14 
 
 
205 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  36.14 
 
 
205 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  35.64 
 
 
205 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  35.09 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.6 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  35.64 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  35.64 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.41 
 
 
203 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  35.87 
 
 
202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  35.87 
 
 
202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  35.87 
 
 
202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>