More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3949 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  100 
 
 
157 aa  319  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  99.36 
 
 
157 aa  315  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.73 
 
 
157 aa  314  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.73 
 
 
157 aa  313  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  98.09 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  98.09 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  98.09 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.09 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  97.45 
 
 
157 aa  310  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  73.08 
 
 
157 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  73.08 
 
 
157 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  73.08 
 
 
157 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  72.44 
 
 
157 aa  236  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  72.44 
 
 
157 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.05 
 
 
153 aa  206  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
181 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
181 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
181 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
181 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  61.11 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  61.73 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  61.11 
 
 
181 aa  194  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  54.66 
 
 
180 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.39 
 
 
176 aa  161  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.4 
 
 
180 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.1 
 
 
188 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.4 
 
 
180 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.61 
 
 
185 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  45.61 
 
 
185 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  45.61 
 
 
185 aa  157  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.75 
 
 
169 aa  152  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.95 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.39 
 
 
671 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.39 
 
 
667 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.39 
 
 
671 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.39 
 
 
671 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.45 
 
 
658 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.27 
 
 
176 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.05 
 
 
653 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.34 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.05 
 
 
653 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.75 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  45.75 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.4 
 
 
653 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.75 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  45.75 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  45.75 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  45.75 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.4 
 
 
653 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.4 
 
 
653 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.68 
 
 
674 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.77 
 
 
176 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  42.07 
 
 
201 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45 
 
 
674 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  44.23 
 
 
639 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  44.23 
 
 
639 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.23 
 
 
639 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.23 
 
 
639 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.23 
 
 
639 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.23 
 
 
641 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.97 
 
 
202 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  39.04 
 
 
203 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  42.95 
 
 
644 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.5 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.5 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  38.5 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  37.97 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  37.97 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  37.97 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  37.97 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  38.5 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  38.5 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  37.97 
 
 
203 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  37.97 
 
 
203 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  37.97 
 
 
203 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  37.43 
 
 
202 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0309  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.68 
 
 
212 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.54 
 
 
154 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.84 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  39.38 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2858  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.23 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.874792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  38.6 
 
 
189 aa  111  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.38 
 
 
652 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>