More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4278 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  61.43 
 
 		 659 aa  840    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  55.35 
 
 		 639 aa  750    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  67.11 
 
 		 472 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  67.11 
 
 		 472 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  55.19 
 
 		 639 aa  750    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  61.43 
 
 		 659 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.49 
 
 		 653 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.88 
 
 		 644 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.59 
 
 		 659 aa  841    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.34 
 
 		 653 aa  817    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  67.11 
 
 		 472 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  67.11 
 
 		 472 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  67.76 
 
 		 472 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  77.12 
 
 		 671 aa  1076    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  67.76 
 
 		 472 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  72.26 
 
 		 667 aa  1026    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.28 
 
 		 659 aa  837    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.43 
 
 		 659 aa  840    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  67.32 
 
 		 472 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.43 
 
 		 659 aa  841    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  67.76 
 
 		 472 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.48 
 
 		 658 aa  811    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  94.81 
 
 		 674 aa  1338    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.49 
 
 		 671 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  55.35 
 
 		 639 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  66.45 
 
 		 472 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  61.43 
 
 		 659 aa  840    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.88 
 
 		 653 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  67.11 
 
 		 472 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  66.23 
 
 		 472 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.34 
 
 		 671 aa  796    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  100 
 
 		 674 aa  1399    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  55.19 
 
 		 641 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  55.35 
 
 		 639 aa  750    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  67.54 
 
 		 472 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.43 
 
 		 659 aa  840    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  67.32 
 
 		 472 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.8 
 
 		 653 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  67.32 
 
 		 472 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  67.11 
 
 		 472 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  55.19 
 
 		 639 aa  748    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.49 
 
 		 653 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.48 
 
 		 652 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  67.11 
 
 		 472 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  65.8 
 
 		 471 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  64.49 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  62.26 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  63.62 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  62.28 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  61.39 
 
 		 471 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  61.62 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  62.47 
 
 		 477 aa  595  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  62.04 
 
 		 477 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  61.4 
 
 		 468 aa  591  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  62.91 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  63.12 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  62.09 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  61.66 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  61.18 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  62.91 
 
 		 472 aa  591  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  61.18 
 
 		 468 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  62.47 
 
 		 472 aa  588  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  61.62 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  61.22 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  60.96 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  60.53 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  60.96 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  60.53 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  61.69 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  60.75 
 
 		 468 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  59.65 
 
 		 483 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  60.75 
 
 		 468 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  62.06 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  60.17 
 
 		 485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  62.06 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  62.06 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  62.28 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  57.17 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  58.87 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  58.79 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  58.79 
 
 		 469 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  60.59 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  59.52 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  57.08 
 
 		 475 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  57.88 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  58.14 
 
 		 481 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  56.96 
 
 		 472 aa  548  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  57.58 
 
 		 465 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  57.58 
 
 		 465 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  55.43 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  55.22 
 
 		 473 aa  535  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  54.78 
 
 		 470 aa  528  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  55.58 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>