More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3989 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  98.73 
 
 
157 aa  314  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  96.82 
 
 
157 aa  310  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  96.82 
 
 
157 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.72 
 
 
157 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  73.72 
 
 
157 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.08 
 
 
157 aa  241  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  73.08 
 
 
157 aa  239  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  72.44 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  72.44 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  72.44 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.44 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.55 
 
 
157 aa  238  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.47 
 
 
153 aa  206  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
181 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
181 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
181 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
181 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  59.88 
 
 
181 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  60.49 
 
 
175 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  59.88 
 
 
181 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  52.17 
 
 
180 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  52.26 
 
 
667 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  50.31 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  50.31 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.31 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.25 
 
 
169 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.23 
 
 
176 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.21 
 
 
180 aa  157  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.45 
 
 
180 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.39 
 
 
173 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.11 
 
 
188 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.03 
 
 
671 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.13 
 
 
674 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.32 
 
 
671 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.17 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.32 
 
 
671 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  51.7 
 
 
659 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
659 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.7 
 
 
653 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.7 
 
 
653 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  48.05 
 
 
162 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.7 
 
 
653 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.13 
 
 
674 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.7 
 
 
653 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.7 
 
 
658 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.05 
 
 
653 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  42.07 
 
 
201 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.99 
 
 
176 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  39.23 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  39.23 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  39.23 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  39.23 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  39.78 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  41.03 
 
 
639 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  41.03 
 
 
639 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.78 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.03 
 
 
639 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  39.78 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  39.78 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.03 
 
 
639 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.78 
 
 
203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.03 
 
 
639 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  39.23 
 
 
203 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  39.23 
 
 
203 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  38.67 
 
 
202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.03 
 
 
641 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0309  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.38 
 
 
212 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  39.23 
 
 
203 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  39.23 
 
 
203 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.12 
 
 
202 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.74 
 
 
644 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.43 
 
 
205 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.72 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.84 
 
 
189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3791  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.52 
 
 
162 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628434  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  39.88 
 
 
189 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
204 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.59 
 
 
652 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>