More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2720 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  96.11 
 
 
180 aa  352  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  59.78 
 
 
180 aa  224  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  57.46 
 
 
181 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.06 
 
 
176 aa  207  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  56.91 
 
 
181 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  56.91 
 
 
181 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  56.91 
 
 
181 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  56.91 
 
 
181 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  56.91 
 
 
181 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  56.65 
 
 
175 aa  197  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.07 
 
 
173 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.91 
 
 
169 aa  187  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  51.11 
 
 
185 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
659 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  50.56 
 
 
185 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.85 
 
 
188 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.56 
 
 
185 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.71 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
671 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  50.57 
 
 
671 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.7 
 
 
653 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.7 
 
 
653 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.7 
 
 
653 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.13 
 
 
653 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.13 
 
 
653 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  49.42 
 
 
671 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.29 
 
 
658 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.84 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.6 
 
 
157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.6 
 
 
157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.54 
 
 
667 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  50 
 
 
157 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  50 
 
 
157 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
157 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  49.4 
 
 
157 aa  158  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  48.21 
 
 
157 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  48.21 
 
 
157 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.25 
 
 
674 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  44.13 
 
 
674 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  48.21 
 
 
157 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  48.21 
 
 
157 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  48.21 
 
 
157 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  47.74 
 
 
652 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.91 
 
 
176 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  40.8 
 
 
162 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  40.8 
 
 
162 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  40.8 
 
 
162 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.8 
 
 
162 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  40.8 
 
 
162 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0309  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.68 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
162 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.19 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  37.85 
 
 
639 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  37.85 
 
 
639 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.85 
 
 
639 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.85 
 
 
639 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.85 
 
 
639 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.68 
 
 
189 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.33 
 
 
641 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.42 
 
 
208 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  40.94 
 
 
201 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  40.93 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.93 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  40.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.29 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  40.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  40.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.01 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.45 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  40.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  40.93 
 
 
205 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.22 
 
 
205 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  40.41 
 
 
205 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  41.82 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  40.86 
 
 
203 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
203 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
203 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  40.32 
 
 
203 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  40.32 
 
 
203 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>