47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0569 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.23 
 
 		 627 aa  639    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 641 aa  1297    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2662  conserved hypothetical protein  49.32 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.11 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 651 aa  340  4e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.172453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.65 
 
 		 630 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2408  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 627 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0492  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 		 254 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.287029  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0473  hypothetical protein  29.47 
 
 		 258 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.736853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 96 aa  50.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 470 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 96 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.59 
 
 		 154 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 96 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 96 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2043  polysulfide reductase, subunit B, putative  38.46 
 
 		 199 aa  47.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.507681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0528  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  32.1 
 
 		 1028 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0026  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  41.18 
 
 		 523 aa  47.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05070  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  39.39 
 
 		 205 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.51 
 
 		 366 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3983  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.27 
 
 		 1099 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02718  predicted oxidoreductase, 4Fe-4S ferredoxin-type subunit  38.46 
 
 		 110 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1336  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.18 
 
 		 199 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 		 206 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2713  putative oxidoreductase, iron-sulfur binding protein  30.11 
 
 		 974 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0503336  normal  0.426471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.38 
 
 		 176 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.25 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  34.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.5 
 
 		 180 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 110 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.58 
 
 		 228 aa  44.3  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  39.58 
 
 		 181 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.5 
 
 		 180 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1111  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 		 139 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000205956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 		 517 aa  43.9  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  38.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  38.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  38.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.9  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  38.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  38.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.062215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>